org.genepi.mean.parser
Class GffParser
java.lang.Object
org.genepi.mean.parser.AbstractParser
org.genepi.mean.parser.GffParser
public class GffParser
- extends AbstractParser
Method Summary |
void |
dispatchComplet(java.lang.String start,
java.lang.String end,
java.lang.String strand,
java.lang.String frame)
Alloc. d'une hypothese correspondante a un hit. |
void |
parse()
|
protected void |
parseGffLine(java.lang.String theline)
Parser de fichier Gff resultat de l'execution d'un externe. |
Methods inherited from class java.lang.Object |
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait |
GffParser
public GffParser(FeatureHandler h,
java.util.Iterator lines)
parse
public void parse()
throws MeanException
- Specified by:
parse
in class AbstractParser
- Throws:
MeanException
parseGffLine
protected void parseGffLine(java.lang.String theline)
- Parser de fichier Gff resultat de l'execution d'un externe.
dispatchComplet
public void dispatchComplet(java.lang.String start,
java.lang.String end,
java.lang.String strand,
java.lang.String frame)
- Alloc. d'une hypothese correspondante a un hit.